OncoGxOne™ディスカバリがんパネル
GENEWIZ OncoGxOne™ディスプレイがんパネルでは、がん研究、バイオマーカー探索、患者の層別化に向けて、包括的なゲノム解析が可能です。最新の研究データをもとに設計・開発されたこれらのアッセイを用いれば、関心のあるがん遺伝子を徹底的に評価できます。 詳しくは以下をご覧ください：OncoGxOne™ディスカバリがんパネルに関してよく寄せられる質問（FAQ）.
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用途
がんのメカニズムに関する研究（突然変異を促す新規物質の特定など）
がん治療標的の探索
· がんバイオマーカー探索
患者の層別化
個別がん治療
特徴と利点
全種類のゲノム異常（一塩基多型（SNP）、挿入欠損、遺伝子融合、コピー数多型（CNV））を検出する能力
19種類のがん特異的パネル
それぞれのパネルによって150～400の腫瘍特異的遺伝子がアッセイされるため、ご希望の遺伝子を柔軟に追加 / 削除できます。
これらのパネルでは、全エクソン / UTR領域、ならびに切断点が示された特定のイントロン領域がターゲットとなります
特定のがんの関心のある部位が徹底的にカバーされるよう設計・検証済み
極めて深いカバレッジで一般的および希少な突然変異を検出
超低量のDNAインプットにも対応
FFPEサンプルとのシーケンシング互換性
関心のある遺伝子を追加できるがんパネルの高いカスタマイズ性
GENEWIZ OncoGxOne™ディスカバリがんパネルのアッセイ対象となっているがんの種類*
- 膀胱がん
- 脳腫瘍
- 乳がん
- 子宮頸がん
- 結腸直腸がん
- 子宮内膜がん
- 肺がん
- リンパ腫
- 黒色腫
- 卵巣がん
- 膵臓がん
- 前立腺がん
- 甲状腺がん
*（既製のパネルに 遺伝子を追加 / 削除する柔軟性を備えた）他の種類のがんを対象としたアッセイの開発も ご要望に応じて承ります.
がんパネルの比較表
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GENEWIZ OncoGxOneTM ディスカバリがんパネル |
Illumina TruSeq© アンプリコンがんパネル |
Ion AmpliSeqTM がんホットスポットパネル |
| シーケンシングプラットフォーム | Illumina MiSeqまたはHiSeq | Illumina MiSeq | Ion PGM® |
| アッセイ対象となるがんの種類 | 特定の種類のがん（組織）に対応した19種類の固有の遺伝子パネルアッセイ | 複数の種類のがんに対応した単一の遺伝子パネルアッセイ | 複数の種類のがんに対応した単一の遺伝子パネルアッセイ |
| カバーされる遺伝子数 | ≈150～ 400 | 48 | 50 |
| ゲノム変異の検出 |
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| ターゲット領域 | ≈2～5.4 Mb（すべてのエクソン、UTR、関連イントロン領域で構成） | ≈35 Kb（突然変異ホットスポットで構成） | ≈39 Kb（突然変異ホットスポットで構成） |
| 平均深度 | > 100x* | ≈ 1000x** | > 10 ng |
| ターゲットエンリッチメント | Agilent SureSelectターゲットエンリッチメント | Illuminaターゲットアンプリコンシーケンシング | Life Technologiesターゲットアンプリコンシーケンシング |
| DNAインプット | > 100 ng | > 250 ng | > 10 ng |
| サンプルの提出 |
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サンプル提出ガイドライン
GENEWIZはがんパネルプロジェクトにおいて、ホルマリン固定 / パラフィン包埋（FFPE）薄片（スライド）、精製ゲノムDNA、新鮮凍結サンプルをお引き受けしています。サンプル提出要件について詳しくは、以下をご覧ください：サンプル提出ガイドライン page.
納品物
いずれのお客様にも生データをFASTQファイルとしてご提出します。ご要望に応じて、突然変異探索およびカスタム式データ解析パッケージもご利用になれます。
次世代シークエンシングプラットフォーム
Azentaは、Illumina認定のサービスプロバイダーです。IlluminaのNovaSeq/HiSeqシリーズに加えて、10X GenomicsのChromium Controller、PacBioのSequelを使用したサービスもご提供しています。詳細は次世代シークエンシングプラットフォームのページをご覧ください>
