DNAサンプル提出ガイドライン

大規模な全ゲノムシーケンシング（>1Gb）

• サンプルの種類：ゲノムDNA
• サンプルの純度：OD260/280：1.8～2.0
• 必要量ならびに濃度：>5µg, >80ng/µl
• 品質管理（QC）を伴う場合の最低必要量：100ng
• 品質管理（QC）を伴わない場合の最低必要量：10ng
• 水またはTEへの再懸濁（<0.1mM EDTA）

小規模な全ゲノムシーケンシング

• サンプルの種類：ゲノムDNA
• サンプルの純度：OD260/280：1.8～2.0
• 必要量ならびに濃度：>1 µg, >80ng/µl
• 品質管理（QC）を伴う場合の最低必要量：100ng
• 品質管理（QC）を伴わない場合の最低必要量：1ng
• 水またはTEへの再懸濁（<0.1mM EDTA）

ChIP-Seq

• サンプルの種類：ChIP DNA
• サンプルの純度：OD 260/280：1.8～2.2
• 必要量ならびに濃度：> 50 ng
• 品質管理（QC）を伴う場合の最低必要量：20ng
• 品質管理（QC）を伴わない場合の最低必要量：5ng
• DNAフラグメント長：500 bp～100 bp（メインピーク：200～300 bp）
• DNAの水またはTEへの再懸濁が必要（< 0.1 mM EDTA）

Agilent SureSelectエクソームエンリッチメントキット、OncoGxOne™ディスカバリがんパネル、TargetGxOne™遺伝子エンリッチメント

• サンプルの種類：ゲノムDNA
• サンプルの純度：OD260/280：1.8～2.0
• 必要量ならびに濃度：>5µg, >80ng/µl
• 品質管理（QC）を伴う場合の最低必要量：250ng
• 品質管理（QC）を伴わない場合の最低必要量：100ng
• 水またはTEへの再懸濁（<0.1mM EDTA）

Ion AmpliSeq™がんホットスポットパネルV2

(Recommended for gDNA extracted from FFPE samples)
• サンプルの種類：ゲノムDNA
• サンプルの純度：OD260/280：1.8～2.0
• 必要量ならびに濃度： >1µg
• 品質管理（QC）を伴う場合の最低必要量：100ng
• 品質管理（QC）を伴わない場合の最低必要量：10ng
• 水またはTEへの再懸濁（<0.1mM EDTA）

Illumina TruSeqアンプリコンがんパネル

• サンプルの種類：ゲノムDNA
• サンプルの純度：OD260/280：1.8～2.0
• 必要量ならびに濃度： >1µg
• 品質管理（QC）を伴う場合の最低必要量：500ng
• 品質管理（QC）を伴わない場合の最低必要量：250ng
• 水またはTEへの再懸濁（<0.1mM EDTA）

カスタムTargetGxOne™アンプリコンシーケンシング

• サンプルの種類：ゲノムDNA
• サンプルの純度：OD260/280：1.8～2.0
• 必要量ならびに濃度： >1µg
• 品質管理（QC）を伴う場合の最低必要量：100ng
• 品質管理（QC）を伴わない場合の最低必要量：10ng
• 水またはTEへの再懸濁（<0.1mM EDTA）

16S MetaVx™パネル

• サンプルの種類：ゲノムDNA
• サンプルの純度：OD260/280：1.8～2.0
• 必要量ならびに濃度：>1µg, >80ng/µl
• 品質管理（QC）を伴う場合の最低必要量：100ng
• 品質管理（QC）を伴わない場合の最低必要量：25ng
• 水またはTEへの再懸濁（<0.1mM EDTA）

FuzeSeq™抗体シーケンシング

• サンプルの種類：混合ファージミドベクターDNA
• サンプルの純度：OD260/280：1.8～2.0
• 必要量ならびに濃度： >1µg
• 品質管理（QC）を伴う場合の最低必要量：100µg
• 品質管理（QC）を伴わない場合の最低必要量：10ng
• 水またはTEへの再懸濁（<0.1mM EDTA）

RNAサンプル提出ガイドライン

Standard RNA-Seq

• サンプルの種類：Total RNA（推奨）またはcDNA（>1µg)
• サンプルの純度：OD260/OD280：1.8～2.2
• RIN≥7.0（Agilent2100 BioAalyzerまたは同等装置で測定）
• 必要量ならびに濃度：>3µg （Total RNA向け）、>80ng/µl
• 品質管理（QC）を伴う場合の最低必要量：50ng（ポリA選択法）または150ng（rRNA枯渇法）
• 品質管理（QC）を伴わない場合の最低必要量：10ng（ポリA選択法）または100ng（rRNA枯渇法）
• ヌクレアーゼフリー水への再懸濁
• 乾燥発送 / 保冷剤を用いた発送にのみ対応

Stranded RNA-Seq

• サンプルの種類：Total RNA（推奨）またはcDNA（>1µg)
• サンプルの純度：OD260/OD280：1.8～2.2
• RIN≥7.0（Agilent2100 BioAnalyzerまたは同等装置で測定）
• 必要量ならびに濃度：>5µg （Total RNA向け）、>80ng/µl
• 品質管理（QC）を伴う場合の最低必要量：150ng（ポリA選択法とrRNA枯渇法の双方）
• 品質管理（QC）を伴わない場合の最低必要量：100ng（ポリA選択法とrRNA枯渇法の双方）
• ヌクレアーゼフリー水への再懸濁
• 乾燥発送 / 保冷剤を用いた発送にのみ対応

Small RNA-Seq

GENEWIZは、小規模なRNA-Seqプロジェクトにおいて、Total RNAまたは精製済みSmall RNAをお引き受けします。
• Total RNA：1µgのTotal RNA（5 µlのヌクレアーゼフリー水内）
• 精製済みSmall RNA（1～10 µgのTotal RNAから精製）を分子グレードの水または10 mM Tris-HCL、pH 8.5（< 0.1 mM EDTA）に溶解

Targeted RNA-Seq

• サンプルの種類：Total RNA（推奨）またはcDNA（>1µg)
• サンプルの純度：OD260/OD280：1.8～2.2
• RIN≥7.0（Agilent2100 BioAnalyzerまたは同等装置で測定）
• 必要量ならびに濃度：>5µg （Total RNA向け）、>80ng/µl
• 品質管理（QC）を伴う場合の最低必要量：1µg
• 品質管理（QC）を伴わない場合の最低必要量：500ng
• ヌクレアーゼフリー水への再懸濁

Single Cell RNA-Seq

• サンプルの種類：溶液中の細胞または少量のTotal RNA
• 細胞数をサンプル提出フォームに明記
• PBS内の細胞については、細胞溶液から直接ライブラリーを精製することが可能。TRIzol内の細胞についてはRNA抽出が必要（細胞数が501～10,000未満の場合は特別RNA抽出が必要となる）
• Total RNAと溶液中の細胞は双方ともドライアイスを用いて発送

抽出要件

FFPEサンプル（DNAおよびRNA）

• &FFPEスライド4枚以上を推奨、反復がある場合にはスライド2枚以上、反復がない場合はスライド最低1枚
• それぞれ5um～20umの厚さ
• 室温で発送、または保冷材を用いて発送

細胞ペレット

• 最大10⁶ の細胞、最低10⁴ の細胞
• GENEWIZ NGSでは細胞培養の提供はなし
• ドライアイスを用いて発送

新鮮凍結組織

• 最低1mg、理想10mg、最大20mg
• ドライアイスを用いて発送

ウイルス粒子

• >1mLの上清
• ウイルス価>5x10⁹ 細胞数/mL
• ドライアイスを用いて発送

全血（DNA）

• サンプルあたりチューブ2本（1本はバックアップ用）を推奨
• 200µl / チューブ
• 保冷剤を用いて発送

血漿 / 血清

• サンプルあたりチューブ2本（1本はバックアップ用）を推奨
• 3～10mL / チューブ
• ドライアイスを用いて発送

便

• 50～100mg、最大250 mg
• ドライアイス / 保冷材を用いて発送

土壌

• 50～100mg、最大250 mg
• 室温または保冷材を用いて発送

水

• 20mL～100 mL
• 室温で発送

綿棒

• サンプルあたりチューブ2本（1本はバックアップ用）を推奨
• 綿棒1本 / チューブ
• 室温で発送

固定針生検

• 最低1本の針生検、3～4本が適量
• 室温または保冷材を用いて発送

急速凍結針生検

• 最低1～3mgの組織、最大20mg
• ドライアイスを用いて発送

 GENEWIZサンプル品質管理評価

GENEWIZは品質管理（QC）を無償で実施し、24時間以内に結果を報告いたします。

他の種類のサンプル、または理想分量に達しないサンプルの提出については、当社のプロジェクト管理チームにご相談ください。お客様のプロジェクトを進める方法について模索いたします。

電子メール： Business.Japan@genewiz.com

弊社まで配送：