分子遺伝学（研究開発およびGLP）

サンプル提出ガイドライン

核酸抽出

サンプルの種類	研究開発	GLP
FFPEサンプル	推奨スライド数: 4枚以上のFFPEスライド最小必要スライド数: 2枚のFFPEスライド厚さ: 5 µm ～ 20 µm 大きさ: 150 mm²以上	利用不可
細胞ペレット	推奨細胞数: 10⁶ 細胞最小必要細胞数: 10⁴ 細胞	1サンプルあたり2本に分け送付ください推奨細胞数: ≧1×10⁷ 細胞 (サンプル1本あたり) 最小必要細胞数: 5×10⁶ ~ 1×10⁷ 細胞 (サンプル1本あたり)
新鮮凍結組織	推奨量: 10 mg 最小必要量: 2 mg	最小必要量: 25 mg 以上
ウイルス粒子	利用不可	利用不可
全血 (DNA抽出)	1サンプルあたり2本に分け送付ください推奨量: 500 µl (サンプル1本あたり) 最小必要量: 200 µl (サンプル1本あたり)	1サンプルあたり2本に分け送付ください推奨量: 500 µl (サンプル1本あたり) 最小必要量: 200 µl (サンプル1本あたり)
全血 (RNA抽出)	1サンプルあたり2本に分け送付ください推奨量: 2.5 ml以上 (サンプル1本あたり、PAXgene Blood RNA Tubeの使用を推奨)	1サンプルあたり2本に分け送付ください推奨量: 2.5 ml以上 (サンプル1本あたり、PAXgene Blood RNA Tubeの使用を推奨)
血漿 / 血清	1サンプルあたり2本に分け送付ください推奨量: 10 ml (サンプル1本あたり) 最小必要量: 5 ml (サンプル1本あたり)	利用不可
糞便	推奨量: 100 mg 最小必要量: 50 mg	利用不可
唾液	推奨量: 1 ml	推奨量: 1 ml
土壌	推奨量: 100 mg 最小必要量: 50 mg	利用不可
水	推奨量: 100 mL 最小必要量: 20 mL	利用不可
綿棒	1サンプルあたり2本 (綿棒2本をそれぞれ別々のチューブに入れる)	利用不可
固定済み針生検	推奨される注射針のサイズ: 直径　1 ～ 2 mm; 長さ 5 mm以上推奨サンプル数: 4本最小必要数: 1本	利用不可
急速凍結済み針生検	推奨量: 10 mg 最小必要量: 3 mg	利用不可

変異同定＆SNPジェノタイピング

サンプルの種類	研究開発	GLP
ゲノムDNAサンプル	推奨量: ≧120 ng 最小必要量: 60 ng 濃度: ≧20 ng/µl	推奨量: ≧200 ng 濃度: ≧20 ng/μl
細胞ペレット	推奨細胞数: 10⁷ 細胞最小必要細胞数: 10⁶ 細胞	1サンプルあたり2本に分け送付ください推奨細胞数: ≧1×10⁷ 細胞 (サンプル1本あたり) 最小必要細胞数: 5×10⁶ ~ 1×10⁷ 細胞 (サンプル1本あたり)
新鮮凍結組織	最小必要量: 25 mg 以上	最小必要量: 25 mg 以上
FFPEサンプル	推奨スライド数: 4枚以上のFFPEスライド最小必要スライド数: 2枚のFFPEスライド厚さ: 5 µm ～ 20 µm 大きさ: 150 mm²以上	核酸抽出後のサンプルに対して作業を実施する事は可能
全血	1サンプルあたり2本に分け送付ください推奨量: 500 µl (サンプル1本あたり) 最小必要量: 200 µl (サンプル1本あたり)	1サンプルあたり2本に分け送付ください推奨量: 500 µl (サンプル1本あたり) 最小必要量: 200 µl (サンプル1本あたり)
酵母コロニー	酵母コロニーが載った寒天プレート	単一のコロニーもしくは適度に分離された複数のコロニーが載った寒天プレート
綿棒	1サンプルあたり2本 (綿棒2本をそれぞれ別々のチューブに入れる)	利用不可
唾液	推奨量: 1 ml	推奨量: 1 ml

16s & ITS rRNAシーケンシング

サンプルの種類	研究開発	GLP
寒天培地上の細菌コロニー	単一のコロニーもしくは適度に分離された複数のコロニーが載った寒天培地	利用不可
寒天培地上の真菌コロニー	単一のコロニーもしくは適度に分離された複数のコロニーが載った寒天培地	利用不可
ゲノムDNAサンプル	推奨量: ≧120 ng 最小必要量: 60 ng 濃度: ≧20 ng/µl	利用不可
細胞ペレット	推奨細胞数: ≧10⁶ 細胞	利用不可
グリセロールストック	推奨量: 200 µl 輸送方法: ドライアイス	利用不可
高層寒天培地	クローンサンプルが含まれる高層寒天培地	利用不可

フラグメント解析

サンプルの種類	研究開発	GLP
ゲノムDNAサンプル	推奨量: 20 µl 最小必要量: 10 µl 濃度: ≧50 ng/µl	利用不可
蛍光ラベル付けされたPCR産物	推奨量: 20 µl 最小必要量: 10µl 濃度: ≧50 ng/µl	利用不可

【フラグメント解析サービスに関する諸注意】
蛍光アッセイには「DS-33: 6FAM、PET、NED、VIC」の4色素が使用できます。サイズマーカーには「LIZ-500標準サイズマーカー」が使用されます。 PCR産物を送付予定の場合、8連チューブまたは96ウェルプレートを用いてサンプルを用意してください (※サンプル数が48未満の場合は8連PCRチューブを使用してください)。サンプル数が48を超える際に、96ウェルPCRプレートを用いて送付いただいた場合に限り割引価格にてサービスを提供しております。また、発送時の乾燥やコンタミネーションを防止するため、チューブまたはウェルを「8連キャップで留める」もしくは「パラフィルムで覆う」対応をお願いしております。ご協力をお願い致します。

gDNA検証

サンプルの種類	研究開発	GLP
ゲノムDNAサンプル	推奨量: ≧120 ng 最小必要量: 60 ng 濃度: ≧20 ng/µl	推奨量: ≧6 µl (≧120 ng) 濃度: ≧20 ng/µl
細胞ペレット	推奨細胞数: ≧10⁷ 細胞最小必要細胞数: 10⁶ 細胞	1サンプルあたり2本に分け送付ください推奨細胞数: ≧1×10⁷ 細胞 (サンプル1本あたり) 最小必要細胞数: 5×10⁶ ~ 1×10⁷ 細胞 (サンプル1本あたり)
新鮮凍結組織	最小必要量: 25 mg 以上	最小必要量: 25 mg 以上
FFPEサンプル	推奨スライド数: 4枚以上のFFPEスライド最小必要スライド数: 2枚のFFPEスライド厚さ: 5 µm ～ 20 µm 大きさ: 150 mm²以上	核酸抽出後のサンプルに対して作業を実施する事は可能
全血	1サンプルあたり2本に分け送付ください推奨量: 500 µl (サンプル1本あたり) 最小必要量: 200 µl (サンプル1本あたり)	1サンプルあたり2本に分け送付ください推奨量: 500 µl (サンプル1本あたり) 最小必要量: 200 µl (サンプル1本あたり)
ウイルス粒子	核酸抽出後のサンプルに対して作業を実施する事は可能	核酸抽出後のサンプルに対して作業を実施する事は可能
綿棒	1サンプルあたり2本 (綿棒2本をそれぞれ別々のチューブに入れる)	利用不可
唾液	推奨量: 1 ml	推奨量: 1 ml

cDNA検証

サンプルの種類	研究開発	GLP
RNAサンプル	最小必要量: 5 µg	最小必要量: 5 µg
cDNAサンプル	最小必要量: 10µl (200ng) 濃度: 20 ng/µl	最小必要量: 10µl (200ng) 濃度: 20 ng/µl
細胞ペレット	推奨細胞数: ≧10⁷ 細胞最小必要細胞数: 10⁶ 細胞	1サンプルあたり2本に分け送付ください推奨細胞数: ≧1×10⁷ 細胞 (サンプル1本あたり) 最小必要細胞数: 5×10⁶ ~ 1×10⁷ 細胞 (サンプル1本あたり)
新鮮凍結組織	最小必要量: ≧25 mg	最小必要量: ≧25 mg
FFPEサンプル	推奨スライド数: 4枚以上のFFPEスライド最小必要スライド数: 2枚のFFPEスライド厚さ: 5 µm ~ 20 µm 大きさ: 150 mm² 以上	核酸抽出後のサンプルに対して作業を実施する事は可能
全血	1サンプルあたり2本に分け送付ください推奨量: 500 µl (サンプル1本あたり) 最小必要量: 200 µl (サンプル1本あたり)	1サンプルあたり2本に分け送付ください推奨量: 500 µl (サンプル1本あたり) 最小必要量: 200 µl (サンプル1本あたり)
ウイルス粒子	核酸抽出後のサンプルに対して作業を実施する事は可能	核酸抽出後のサンプルに対して作業を実施する事は可能

定量PCRサービス

サンプルの種類	研究開発	GLP
ゲノムDNAサンプル	推奨量: ≧5 µg 最小必要量: 2 µg 濃度: ≧50 ng/μl	利用不可
RNAサンプル	推奨量: ≧5 µg 最小必要量: 2 µg 濃度: ≧50 ng/μl RIN 値: ≧6	利用不可
cDNAサンプル	推奨量: ≧ 5µg 最小必要量: 2 µg 濃度: ≧50 ng/μl RIN 値: ≧6	利用不可
細胞ペレット	推奨細胞数: 10⁶ 細胞最小必要細胞数: 10⁴ 細胞	利用不可
新鮮凍結組織	推奨量: 10 mg 最小必要量: 2 mg	利用不可

モノクローナル抗体シーケンシング

サンプルの種類	研究開発	GLP
ハイブリドーマ細胞	最小必要細胞数: ≧10⁶ 細胞	利用不可
ハイブリドーマ細胞溶解液	TRIzol Reagentで溶解したハイブリドーマ細胞最小必要細胞数: ≧10⁶ 細胞	利用不可
RNAサンプル	最小必要量: ≧10 µl (≧2 µg) 濃度: ≧100 ng/μl RIN 値: ≧7 RNAの分解がない事を事前に確認ください	利用不可

プラスミドシーケンシング

サンプルの種類	研究開発	GLP
プラスミドDNA	プライマーウォーキング	最低5 µg / kb
グリセロールストック	プライマーウォーキング	1サンプルあたり2本に分け送付ください推奨量: ≧200 µl (サンプル1本あたり) 輸送方法: ドライアイス
寒天培地上の細菌コロニー	プライマーウォーキング	単一のコロニーもしくは適度に分離された複数のコロニーが載った寒天プレート

プラスミド調製

サンプルの種類	研究開発	GLP
プラスミドDNA	プラスミド調製	最小必要量: 5 µg
グリセロールストック	プラスミド調製	1サンプルあたり2本に分け送付ください推奨量: 200 µl (サンプル1本あたり) 輸送方法: ドライアイス
寒天培地上の細菌コロニー	プラスミド調製	単一のコロニーもしくは適度に分離された複数のコロニーが載った寒天培地

酵母コロニーシーケンシング

サンプルの種類	研究開発	GLP
寒天培地上の酵母コロニー	単一のコロニーもしくは適度に分離された複数のコロニーが載った寒天培地	単一のコロニーもしくは適度に分離された複数のコロニーが載った寒天培地

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受託サービスご利用上の諸注意

提出いただくサンプルの状態により「解析に必要となる品質/量のgDNAを確保できない」、「良好なシークエンス結果が得られない」等の問題が発生する場合があります。このような場合、解析を中断し、今後の方針に関してお客様にご相談する可能性があります事、予めご了承ください。
個人情報に関わるサンプルは、お客様のご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究の目的で使用されることが承認済みである必要があります。また、ご発送いただく際のサンプル名等の一切の情報は匿名化されている必要があります。
病原性/感染性のあるサンプルは、お取り扱いできない場合がございます。事前の情報提供をお願いしておりますのでご協力ください。
「サンプル情報の事前申告」がない場合、解析作業を実施できません。情報提出のない場合は納期の遅延につながりますのでご協力をお願いいたします。
ご提出のサンプルの保管期間は解析完了・納品後、約3ヵ月となります。保管期間を過ぎたサンプルはお断りなく弊社の方で処理させていただきます。
期間を超えたサンプルの保管をご希望の場合は、別途サンプル保管料金を頂き対応とさせていただきます。予めご了承ください。

スモールゲノムNGSを除く、GLP順守サービスの発送方法

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