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Séquençage de nouvelle génération
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Séquençage d'ARNSéquençage du génome entierReséquençage ciblé &et panels de gènes à façonSéquençage d'exomesSéquençage métagénomique -16S MetaVxSéquençage d'ampliconsContamination par des agents adventicesSolutions bioinformatiquesSolutions de séquençage de nouvelle génération autonomes
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Séquençage de Sanger
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Matrices purifiéesSéquençage de matrices difficilesBactéries et phagesACP non purifiéeServices premium
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Synthèse de gènes
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Synthèse de gènes standardTurboGENE™Banques d'ADN synthétiquesSynthèse de structures CRISPR
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Génétique moléculaire
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Séquençage de l'ARNr 16SServices de vérification de l'ADNc et de l'ADNgAnalyse de fragmentsAnalyse de mutations et de polymorphismes mononucléotidiquesSéquençage de colonies de levures
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Préparation d'ADN plasmidique
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Préparation d'ADN plasmidique
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Services réglementaires BPL
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Séquençage de confirmationAnalyse de mutations et de polymorphismes mononucléotidiquesPréparation plasmidiqueExtraction d'acides nucléiques
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Métagénomique
Les chercheurs commencent juste à comprendre la complexité des communautés microbiennes et leur impact sur la santé de l'homme, des sols, des océans, ainsi que sur l'environnement. Le dysfonctionnement des microbiomes a été associé à des problèmes complexes, tels que les maladies, les mauvaises récoltes, les changements climatiques et les catastrophes écologiques. L'analyse de la composition et de la répartition des microbiomes peut améliorer la compréhension de la cause première de ces problèmes et mettre en évidence des solutions possibles.
Étude des microbiomes
Les analyses métagénomiques peuvent inclure les méthodes classiques de séquençage Sanger du gène codant pour l'ARN ribosomique 16S pour les bactéries et les archéebactéries mises en culture dans le laboratoire, ainsi que l'analyse des communautés microbiennes 16S avancées via le séquençage de nouvelle génération et les approches massivement parallèles, directement à partir d'échantillons environnementaux. Le séquençage complet et aléatoire du génome du microbiome via le séquençage de nouvelle génération est une autre méthode fréquemment utilisée pour analyser tous les gènes présents dans une communauté microbienne, fournissant non seulement une analyse phylogénétique mais aussi un aperçu des capacités fonctionnelles de chaque espèce dans la communauté.La recherche en métagénomique
Exemples d'applications de recherche en métagénomique et sur les microbiomes :
Les chercheurs en agriculture séquencent les micro-organismes des échantillons de sol des cultures saines et non saines de façon à identifier de possibles espèces de bactéries et d'archéebactéries qui peuvent être utilisées dans le développement de traitements de sol pour améliorer la santé des cultures.
Les spécialistes de l'environnement étudient les interactions complexes des communautés microbiennes dans les écosystèmes sains et non sains afin de mieux comprendre comment la population et la composition des microbiomes affectent la santé et le fonctionnement de l'environnement.
Les médecins étudient le lien entre, d'une part, l'intestin et d'autres microbiomes et, d'autre part, des états pathologiques tels que le diabète, la maladie d'Alzheimer et les infections bactériennes. La composition de ces communautés microbiennes peut être étudiée avant et après un traitement médicamenteux ou thérapeutique pour examiner les effets ciblés et non ciblés du traitement, donnant un aperçu de la viabilité du traitement et de la santé du patient.
Applications
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Séquençage de Sanger du gènes codant pour l'ARNr 16S
Nous proposons des services de séquençage de gènes ARNr 16S basés sur la méthode de Sanger pour l'identification des colonies d'archées ou de bactéries clonales isolées. Incluant l'amplification en chaîne par polymérase et le séquençage de Sanger, ce service est idéal pour les situations qui nécessitent une analyse approfondie d'échantillons uniques et isolées plutôt que l'analyse de la composition de communautés.
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MetaVXTM
La solution métagénomique 16S propriétaire de GENEWIZ permet une approche massivement parallèle de l'analyse des communautés microbiennes 16S pour la documentation de toutes les bactéries et archées dans un échantillon, y compris les espèces peu fréquentes et difficiles à mettre en culture. La solution MetaVxTM 2.0 fournit une spécificité améliorée par rapport aux méthodes de séquençage de gènes ARNr 16S V4 classiques en traitant les régions V3, V4 et V5 dans les échantillons environnementaux, et les régions V3 et V4 dans les échantillons de mammifères. Grâce aux diagrammes, tableaux et graphiques de données prêts à la publication, l'analyse bioinformatique utilisant le logiciel QIIME (1) permet aux chercheurs de faciliter l'analyse des données métagénomiques.
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Séquençage complet du génome
Nos solutions de séquençage complet du génome permettent l'exploration de génomes entiers de votre bactérie ou archée d'intérêt. Grâce à cette option, les scientifiques approfondissent les génomes de tout organisme d'intérêt identifié, en cherchant des mutations pertinentes sur le plan environnemental ou étiologique ou des modifications du génome à grande échelle. Les services d'analyse métagénomique de GENEWIZ via le séquençage de nouvelle génération incluent l'approche à lecture courte et haut débit, ainsi que les toutes nouvelles méthodes à lecture longue pour les génomes complexes ou hautement répétitifs.
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