Génétique moléculaire (recherche et développement, BPL)

Recommandations relatives à l'envoi d'échantillons

Séquençage de l'ARNr 16S

Type d'échantillon Recherche et développement BPL
Colonie bactérienne sur gélose Plaque de gélose avec colonies uniques et bien isolées Non disponibles
gDNA Au moins 60 ng par échantillon, concentration de 20 ng/µl, échantillons homogènes uniquement pour ce service Non disponibles
Stocks de glycérol 200 µl de stock congelé sur de la neige carbonique, échantillons homogènes uniquement pour ce service Non disponibles
Tubes de gélose Tube de gélose avec échantillon clonal Non disponibles

Analyse de fragments

Type d'échantillon Recherche et développement BPL
Produits d'ACP étiquetés 10-20 µl équivalent de produit d'ACP  Non disponibles

Extraction d'acide nucléique

Type d'échantillon Recherche et développement BPL
Échantillons de culots cellulaires de mammifères congelés Au moins 1 x 10à 1 x 107 cellules par culot Au moins 5 x 106  à 1 x 107 cellules par culot (2 culots de préférence), dépassement possible de 1 x 107  cellules par culot
Tissus de mammifères congelés Au moins 25 mg Au moins 25 mg
Lamelles de tissus FFIP 4 coupes par échantillon, au moins 20 µm par coupe Non disponibles
Échantillons de sang 200 µl de sang Non disponibles

Vérification de l'ADNc

Type d'échantillon Recherche et développement BPL
ARN Au moins 5 µg Au moins 5 µg
ADNc Au moins 200 ng par échantillon, concentration de 20 ng/µl Au moins 200 ng par échantillon, concentration de 20 ng/µl 
Échantillons de culots cellulaires de mammifères congelés Au moins 1 x 106 à 1 x 107 cellules par culot, dépassement possible de 1 x 107  cellules par culot Au moins 5 x 106  à 1 x 107 cellules par culot (2 culots de préférence), dépassement possible de 1 x 107  cellules par culot
Tissus de mammifères congelés Au moins 25 mg Au moins 25 mg
Lamelles de tissus FFIP 4 coupes par échantillon, au moins 20 µm par coupe Travail pouvant être effectué sur des matières déjà extraites de ce type d'échantillon
Blocs de tissus FFIP 4 coupes par échantillon, 10-20 µm par coupe Travail pouvant être effectué sur des matières déjà extraites de ce type d'échantillon
Échantillons de sang 200 µl de sang Travail pouvant être effectué sur des matières déjà extraites de ce type d'échantillon
Virus Si ARN : au moins 5 µg (~ 200 µl) d'ARN par échantillon (2 flacons par échantillon)

If cell free viral particles:  1 x 107 à 1 x 1012 particules par ml, envoi de 1 ml, 2 flacons de préférence

If frozen allantoic fluid: at least 1 ml
 Si ARN : au moins 5 µg (~ 200 µl) d'ARN par échantillon (2 flacons par échantillon)

If cell free viral particles:  1 x 107 à 1 x 1012 particules par ml, envoi de 1 ml, 2 flacons de préférence

If frozen allantoic fluid: at least 1 ml

Vérification de l'ADNg

Type d'échantillon Recherche et développement BPL
Échantillons d'ADN génomique Au moins 60 ng par échantillon, par amplicon, concentration de 20 ng/µl  Au moins 120 ng par échantillon, concentration de 20 ng/µl
Échantillons de culots cellulaires de mammifères congelés Au moins 1 x 106 à 1 x 107 cellules par culot, dépassement possible de 1 x 107  cellules par culot

Au moins 5 x 106  à 1 x 107 cellules par culot (2 culots de préférence), dépassement possible de 1 x 107  cellules par culot

Tissus de mammifères congelés Au moins 25 mg Au moins 25 mg
Lamelles de tissus FFIP 4 coupes par échantillon, au moins 20 µm par coupe Travail pouvant être effectué sur des matières déjà extraites de ce type d'échantillon
Blocs de tissus FFIP 4 coupes par échantillon, 10-20 µm par coupe Travail pouvant être effectué sur des matières déjà extraites de ce type d'échantillon
Échantillons de sang 200 µl de sang Travail pouvant être effectué sur des matières déjà extraites de ce type d'échantillon
Virus Si ARN : au moins 5 µg (~ 200 µl) d'ARN par échantillon (2 flacons par échantillon)

If cell free viral particles:  1 x 107 à 1 x 1012 particules par ml, envoi de 1 ml, 2 flacons de préférence

If frozen allantoic fluid: at least 1 ml

Si ARN : au moins 5 µg (~ 200 µl) d'ARN par échantillon (2 flacons par échantillon)

If cell free viral particles:  1 x 107 à 1 x 1012 particules par ml, envoi de 1 ml, 2 flacons de préférence

If frozen allantoic fluid: at least 1 ml

Analyse de mutations et de polymorphismes mononucléotidiques

Type d'échantillon Recherche et développement BPL
Échantillons d'ADN génomique Au moins 60 ng par échantillon, par amplicon, concentration ≥ 20 ng/μL Au moins 200 ng par échantillon, concentration de 20 ng/µl
Échantillons de culots cellulaires de mammifères congelés Au moins 1 x 106 à 1 x 107 cellules par culot Au moins 5 x 106  à 1 x 107 cellules par culot (2 culots de préférence), dépassement possible de 1 x 107  cellules par culot
Tissus de mammifères congelés Au moins 25 mg  Au moins 25 mg
 Lamelles de tissus FFIP 4 coupes par échantillon, 10-20 µm par coupe Travail pouvant être effectué sur des matières déjà extraites de ce type d'échantillon
 Blocs de tissus FFIP 4 coupes par échantillon, 10-20 µm par coupe Travail pouvant être effectué sur des matières déjà extraites de ce type d'échantillon
Échantillons de sang 200 µl de sang Travail pouvant être effectué sur des matières déjà extraites de ce type d'échantillon
Colonie de levures Plaque de gélose avec colonies de levures Plaque de gélose avec colonies uniques et bien isolées

Séquençage de plasmides

Type d'échantillon Recherche et développement BPL
ADN plasmidique Arpentage chromosomique
Au moins 5 µg par kb
Stock de glycérol Arpentage chromosomique >200 µl de stock congelé sur de la neige carbonique, 2 stocks de préférence
Colonie bactérienne sur gélose Arpentage chromosomique Plaque de gélose avec colonies uniques et bien isolées

Préparation plasmidique

Type d'échantillon Recherche et développement BPL
ADN plasmidique Préparations Au moins 5 µg
Stock de glycérol Préparations 200 µl de stock congelé sur de la neige carbonique, 2 stocks de préférence
Colonie bactérienne sur gélose Préparations Plaque de gélose avec colonies uniques et bien isolées

Séquençage de colonies de levures

Type d'échantillon Recherche et développement BPL
Colonies de levures Plaque de gélose avec colonies uniques et bien isolées Plaque de gélose avec colonies uniques et bien isolées

Instructions d'expédition pour le service d'analyse de fragments

GENEWIZ recommande le jeu de fluorochromes DS-33 (6FAM, PET, NED et VIC avec la norme de taille LIZ-500) pour le développement d'analyses.

Préparez les échantillons dans des barrettes de 8 tubes ou une plaque à 96 cupules. Pour les commandes de moins de 48 échantillons, veuillez utiliser des barrettes de 8 tubes d'ACP de 0,2 ml. Pour les commandes de plus de 48 échantillons, des tarifs réduits sont disponibles pour les plaques d'ACP à 96 cupules. Veuillez utiliser des cupules ou bouchons pour barrettes de 8 tubes et les envelopper dans du Parafilm ; c'est la meilleure façon d'empêcher le séchage et la contamination croisée durant le transport.

Expédition d'échantillons : veuillez utiliser une boîte de dépôt locale ou un coursier à votre établissement. Veuillez nous contacter pour obtenir la liste complète des boîtes de dépôt locales ou des sites de collecte par coursier. Si aucune boîte de dépôt ou aucun site de collecte par coursier n'est disponible à votre établissement, veuillez expédier les échantillons à température ambiante via le service de livraison express FedEx à :

GENEWIZ-MD
À l'attention de : Analyse de fragments
7210 Corporate Court
Suite C
Frederick, MD 21703
États-Unis
908-222-0711


INSTRUCTIONS D'EXPÉDITION POUR TOUS LES SERVICES DE RECHERCHE ET DE DÉVELOPPEMENT EXCEPTÉ L'ANALYSE DE FRAGMENTS

Expédition directe (FedEx, UPS) :
Si aucune boîte de dépôt n'est disponible, ou si vos matières premières nécessitent de la neige carbonique, veuillez utiliser un service de livraison express, tel que FedEx ou UPS. Le formulaire de commande au format Excel doit être imprimé et inclus avec les matières.
 
Adresse de toutes les expéditions directes :  
 
GENEWIZ
À l'attention de : Équipe de gestion de projets
115 Corporate Boulevard
South Plainfield, NJ 07080
États-Unis
908-222-0711

Boîte de dépôt GENEWIZ (le cas échéant) :
Les matières premières stables à température ambiante doivent être envoyées via une boîte de dépôt GENEWIZ (le cas échéant).  Le formulaire de commande au format Excel doit être imprimé et inclus avec les matières. Contactez-nous à l'adresse dnaseq@genewiz.com pour demander la collecte d'une boîte de dépôt sur votre site ou si vous avez des questions sur les boîtes de dépôt.
 

Instructions d'expédition pour tous les services conformes à la réglementation BPL excepté le séquençage de nouvelle génération de petits génomes

Adresse de toutes les expéditions directes via FedEx, UPS ou World Courier :  

GENEWIZ
MG-GLP
126 Corporate Boulevard
South Plainfield, NJ 07080
États-Unis
908-222-0711

Veuillez inclure une copie du formulaire d'enregistrement d'échantillons.